有帶清洗架的隔膜壓濾機，可拆卸濾布，利用清洗架自動清洗濾板表面。沒有清潔裝置的機器可以使用手動高壓清潔泵進行清潔，對于一些對酸或鈣敏感的頑固污垢或沉淀物，可以取下濾板，浸泡在相應的溶液中，然后用上述方法清潔。
流道中的某些材料不易清潔，只能手動或機械或化學輔助清潔。
清洗壓濾機濾板。明流單向洗滌是洗滌液從止推板的洗滌液進口孔依次進入，經過濾布，再經過濾餅，從無孔濾板流出。出口噴嘴處于關閉狀態，非穿孔板的出口噴嘴處于打開狀態。
明流雙向沖洗是指洗液從止推板上方兩側進入孔內，連續沖洗兩次，即從一側沖洗，然后從另一側沖洗。洗液的出口與入口相同。角線的方向，所以也叫雙向交叉洗滌。
潛流單向清洗是指洗液從止推板的洗液進口孔依次進入多孔板，通過隔膜壓濾機的濾布，然后通過濾餅，從無孔濾板流出。潛流雙向沖洗是指洗液連續兩次進入擋板上側的兩個孔，即先從一側沖洗，再從另一側沖洗，洗液出口為對角方向，也稱為潛流雙向交叉沖洗。
